耐药相关突变(Resistance-associated substitutions, RASs)是丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)治疗的关键因素, 并与一些直接抗病毒药物(Direct acting antivirals, DAAs)为基础的治疗方案的治疗结果相关。在本研究中, 我们主要分析了三个Ib期临床试验(磷酸依米他韦、KW-136和福比他韦)中, 基线Y93H或Y93Y/H耐药突变对NS5A抑制剂单药给药后短期疗效的影响, 并且分析了基线RASs、给药后出现的RASs的发生率。共94例HCV基因型(Genotype, GT)1b (n = 63)和HCV GT-2a (n = 31)的中国初治慢性丙型肝炎(Chronic hepatitis c, CHC)患者被纳入三个Ib期临床试验。本研究中使用Sanger测序法(Sanger sequencing)和二代测序法(Next generation sequencing, NGS)检测了77例患者的耐药突变情况。磷酸依米他韦7天给药试验中, 在30和200 mg剂量组中, 存在基线期Y93H或Y93Y/H突变的患者, 平均最大HCV RNA下降值低于无该突变的患者, 分别为0.83 vs. 2.45 log10 IU/mL和1.92 vs. 2.63 log10 IU/mL。在KW-136 3天给药试验中, 在30、60和120 mg剂量组中, 存在基线期Y93H或Y93Y/H突变的患者, 平均最大HCV RNA下降值低于无该突变的患者, 分别为1.58 vs. 2.89 log10 IU/mL、3.16 vs. 4.09 log10 IU/mL和3.00 vs. 5.04 log10 IU/mL。在福比他韦3天单药给药试验中, 只有30 mg剂量组存在基线期Y93H或Y93Y/H突变, 其中存在基线期Y93H或Y93Y/H突变的患者, 平均最大HCV RNA下降值低于无该突变的患者, 为1.45 vs. 3.59 log10 IU/mL。三个试验中, 共54例(70.1%; 54/77)患者被检测到了基线期RASs。最普遍的基线RASs是Y93H和Y93Y/H, 为18.2% (14/77), 其次为L31M (16.9%; 13/77)。DAA单药给药后最普遍出现的RASs是Y93H和Y93Y/H。我们的数据可为以后的临床治疗及临床试验提供参考。