小肽对Hoechst 33258与DNA特异部位结合的竞争性作用

小肽对Hoechst 33258与DNA特异部位结合的竞争性作用

杨铭, 朱树梅, 黄艳萍, 胡齐悦, 王夔

北京医科大学天然药物及仿生药物国家重点实验室, 北京 100083

收稿日期:1996-03-27 修回日期:1996-06-24 出版日期:1996-09-15 发布日期:1996-09-15

Studies of Site Specific DNA Binding of Small Peptides by Competitive Assays with Hoechst 33258

Ming Yang, Shu-Mei Zhu, Yan-Ping Huang, Qi-Yue Hu, Kui Wang

National Research Laboratories of Natural and Biomimetic Drugs; Beijing Medical University; Beijing 100083

Received:1996-03-27 Revised:1996-06-24 Online:1996-09-15 Published:1996-09-15

摘要/Abstract

摘要： 为了了解小肽如何识别DNA特异的结合位点, 我们研究了两个小肽YR和GGH对DNA与Hoechst 33258特异结合的竞争性抑制作用。对Lineweaver-Burk图的分析显示当Hoechst 33258的浓度在3.66 (10^-9 mol/L to 1.09 ( 10^-8 mol/L范围内, 这种作用是典型的竞争性抑制作用, YR结合在DNA小沟区(AT富集区), 结合常数为1.02 ( 108 (mol/L)^-1, 而GGH的AT富集区结合特异性在浓度高时明显减弱, 因为它也能与GC碱基结合。

关键词: DNA, 小肽, 竞争性抑制剂, 部位特异性结合

Abstract: With a view to finding out precisely how small peptides recognize a particular binding site of DNA, we have accomplished DNA binding studies of two peptides, H-Tyr-Arg-OH (YR) and H-Gly-Gly-His-OH (GGH) by using measurements in comparison with the binding between DNA and Hoechst 33258. The inhibition mode by YR and GGH to DNA binding of Hoechst 33258 was analyzed by Lineweaver-Burk plot which shows the plot of typical competitive inhibition at concentration of Hoechst 33258 from 3.66 (10^-9 mol/L to 1.09 ( 10^-8 mol/L. And it is concluded that YR binds to DNA in its minor groove (AT rich regions) with a binding constant K = 1.02 ( 108 (mol/L)^-1. The GGH (s specificity is reduced at high concentration because it can also bind GC base pair.

Key words: DNA, Peptide, Competitive inhibitor, Site specific binding

Supporting:

杨铭, 朱树梅, 黄艳萍, 胡齐悦, 王夔. 小肽对Hoechst 33258与DNA特异部位结合的竞争性作用[J]. .

Ming Yang, Shu-Mei Zhu, Yan-Ping Huang, Qi-Yue Hu, Kui Wang . Studies of Site Specific DNA Binding of Small Peptides by Competitive Assays with Hoechst 33258[J]. .

[1]	逯颖媛, 张梅, 尹胜菊, 董晓娜, 张志远, 程海旭, 屠鹏飞, 窦桂芳, 车永胜, 徐争辉, 徐枫, 王宪, 吕闯, 楼雅卿, 章国良. 异源物代谢的表观遗传学变异影响抗癫痫药3,4-DCPB药物代谢动力学表型个体差异[J]. 中国药学(英文版), 2023, 32(1): 1-16.
[2]	庞雨浓, 梁英文, 王玉刚, 雷帆, 袁梽漪, 邢东明, 李俊, 杜力军. 小檗碱通过调节PPARγ启动子甲基化对缺血再灌注脑损伤的作用[J]. 中国药学(英文版), 2018, 27(3): 170-182.
[3]	杨益, 易凡, 张沛, 李华, 杜权. Dnmt1通过Cdkn1a甲基化调控脂肪分化的过程[J]. 中国药学(英文版), 2017, 26(7): 488-495.
[4]	黄文芳, 张藏蔓, 李森森, 梁毅, 王弘, 陈世忠. 在线HPLC-DAD-MSn-DNA-AO-FLD系统的建立及紫草中DNA结合活性化合物的研究[J]. 中国药学(英文版), 2015, 24(9): 581-590.
[5]	顾曼曼, 何燕飞, 韩春杨, 周祺, 刘腾飞, 黄燕飞, 刘翠艳. 黄连对小鼠成纤维细胞L929的毒性实验研究[J]. 中国药学(英文版), 2015, 24(2): 111-120.
[6]	楚明明, 袁霞, 贾璇, 孙婷, 郭维, 蒋晓, 刘敬弢, 李润涛, 崔景荣. 环磷酰胺衍生物SLXM-2对小鼠肝癌H22细胞的DNA损伤作用[J]. 中国药学(英文版), 2014, 23(1): 16-21.
[7]	杨青, 朱继让, 孙崎^, 崔景荣, 李润涛, 葛泽梅^. 新型环磷酰胺前药: 环磷酰胺哌嗪季铵盐的构效关系[J]. , 2010, 19(1): 24-33.
[8]	贺巍巍, 刘昭飞, 刘丹, 贾兵, 王凡^, 崔育新^*. 以DNA修复蛋白AGT为靶向的PET显像剂前体O⁶-苄基鸟嘌呤类似物的体外初步生物评价 [J]. , 2008, 17(1): 70-74.
[9]	王陆军, 岳鹏飞, 赵艳玲, 蔡培烈, 周旭, 袁海龙^*. 氧化苦参碱磷脂复合物的制备及其体外抗乙肝病毒活性的研究[J]. , 2007, 16(2): 146-152.
[10]	戴美玲, 严拯宇^*, 曲萍, 邵秀芬. 功能性L-Cys-CdS纳米粒子共振光散射法测定脱氧核糖核酸[J]. , 2006, 15(2): 109-114.
[11]	郭明^*, 谭非, 胡润淮, 俞庆森. 丝裂霉素与DNA在固体石墨电极上的相互作用研究[J]. , 2005, 14(4): 199-203.
[12]	黄文哲, 董婷霞, 戚欢阳, 卢振强, 詹华强^*. 基于5S-rRNA基因间区碱基序列鉴定繁缕[J]. , 2005, 14(3): 144-148.
[13]	徐志栋, 刘河, 王敏, 肖苏龙, 杨铭^*, 卜显和. 具有抗肿瘤活性的6,7-二氰基-二吡啶基[2,2-d:2',3'-f]喹喔啉合钴(II)配合物的合成、晶体结构及与DNA结合的研究[J]. , 2002, 11(4): 125-131.
[14]	张灵霞, 胡育筑. 激光辐射对DNA损伤效应的初步研究[J]. , 2002, 11(1): 11-15.
[15]	林伟, 肖苏龙, 杨铭^*. β-咔啉-3-甲酰胺类衍生物的合成及与DNA的作用[J]. , 2001, 10(3): 119-123.